LINAC的EMC是系统工程。脉冲调制器产生的极高dV/dt和dI/dt是主要干扰源,其高压脉冲电缆需采用双层甚至三层屏蔽的同轴电缆。所有为高功率部件供电的直流电源,其输入端应安装特种EMI滤波器,能承受大电流并滤除低频至高频噪声。整个机架和治疗头的金属结构必须连续焊接,良好接地,形成法拉第笼。控制系统的敏感数字板卡应安装在独立的屏蔽机柜内,通过光纤与功率部分通信。机房电源入口需安装工业级防雷浪涌保护器SPD.